Indicar o risco de ocorrência de determinadas pragas e doenças dos citros como é o caso de Diaphorina citri, psilídeo vetor da bactéria associada ao Huanglongbing (HLB), principal doença da citricultura e da podridão floral, causada por Colletotrichum spp. é essencial na decisão dos citricultores por novos plantios ou aumento de área plantada de citros como é o caso do cinturão citrícola e sua expansão.Essa indicação virá do desenvolvimento de modelos computacionais. Modelos correlativos de distribuição de espécies como o MaxEnt (modelo de máxima entropia), modelos lineares generalizados (regressão linear e logística), modelos generalizados aditivos e análises discriminantes, árvores de regressão e classificação, árvores aleatórias e redes neurais artificiais, Gompertz e Logístico serão testados, comparados, selecionados e validados para a predizer a ocorrência de D. citri e de PFC em regiões de cinco estados compreendidos pelo cinturão citrícola expandido (CCE). Os modelos computacionais utilizarão variáveis preditoras climáticas e biológicas associadas ao hospedeiro (citros),à bioecologia de D. citri e ao monociclo de Colletotrichum spp. A ocorrência de D. citri e de PFC no CCE será indicada com, pelo menos, três níveis de favorabilidade e a comparação e seleção dos modelos se baseará principalmente no critério Akaike de informação (AIC, do inglês).

O Laboratório de Vacinologia, coordenado pelos professores Odir Antônio Dellagostin e Thaís Larré Oliveira, está localizado junto ao Núcleo de Biotecnologia do Centro de Desenvolvimento Tecnológico. O laboratório conta com acadêmicos de graduação, mestrado e doutorado, que realizam suas atividades na área de desenvolvimento de vacinas recombinantes, a partir da predição in silico de potenciais antígenos vacinais, seguido de expressão e purificação destes antígenos, e avaliação de seu potencial imunoprotetor em modelo animal. Ainda, as atividades do laboratório também são voltadas para o desenvolvimento de testes de diagnóstico molecular, para a caracterização molecular de novos isolados bacterianos e para o emprego de Mycobacterium bovis Bacilo Calmette-Guérin (BCG) como vetor vacinal. O bolsista terá a oportunidade de atuar diretamente na clonagem de genes, expressão e purificação de proteínas recombinantes, bem como no acompanhamento de testes de protótipos de vacinas em modelos animais de leptospirose. (AU)

O microambiente tumoral da medula óssea apresenta um papel essencial para a progressão das células leucêmicas. A interação recíproca entre as células neoplásicas, estromais e endoteliais, bem como a interação destas células com componentes da matriz extracelular e fatores solúveis cria um ambiente propício para o desenvolvimento e progressão tumoral, além de afetar a resposta à terapia. Dessa forma, o desenvolvimento de metodologias in vitro que se aproximem da dinâmica encontrada in vivo são relevantes para o estudo da biologia tumoral e para o desenvolvimento de novas intervenções terapêuticas. Assim, durante o período de estágio do bolsista, propomos o desenvolvimento e/ou aprimoramento de métodos para análise do nicho hematopoiético da medula óssea a partir de uma cocultura 3D utilizando uma esponja hemostática de colágeno hidrolisado (gelfoam) para mimetizar a matriz extracelular e células que compõem o microambiente tumoral na medula óssea, como as células leucêmicas, mesenquimais estromais e endoteliais. Uma vez que este modelo imita idealmente as condições fisiopatológicas e o microambiente natural, torna-se uma plataforma fundamental para testes de antineoplásicos que já estão sendo testados no Centro de Hematologia e Hemoterapia da UNICAMP. Ainda, objetivamos que o bolsista, por meio da atuação no projeto, desenvolva novas habilidades laboratoriais e aplique os conhecimentos adquiridos em seus projetos na instituição de origem, os quais também buscam o desenvolvimento de coculturas 3D. (AU)

O objetivo do estudo é predizer via rede neural artificial a(s) variedade(s) de tomate mais adequada(s) aos processamentos térmicos estudados a partir da avaliação dos parâmetros de qualidade em comparação aos frutos in natura. Serão investigadas 5 variedades de tomate produzidas na cidade de Tupã-SP em relação aos parâmetros físico-químicos de qualidade - umidade, pH, acidez titulável (AT), sólidos solúveis (SS), 'Ratio' (relação SS/AT) - e bioquímicos - compostos fenólicos, flavonoides, carotenoides, peroxidação lipídica, peróxido de hidrogênio, açúcares totais, licopeno, ²-caroteno e clorofilas a e b. Os frutos serão colhidos quando atingirem coloração vermelho-brilhante e transportados ao Laboratório de Biologia da Faculdade de Ciências e Engenharia da Unesp de Tupã para serem selecionados e avaliados in natura e após serem submetidas à cocção para obtenção de molho, desidratadas e liofilizadas. Ao final do experimento, espera-se a aplicação da rede neural artificial seja capaz de predizer as variedades mais adequadas para os processamentos utilizados e que que os resultados obtidos tragam elucidações acerca da influência do processamento térmico na quantificação de compostos citados e atividades antioxidante das variedades estudadas.

Neste projeto, pretende-se estudar a ação do ácido mirsinóico, um composto com potencial atividade antimicrobiana e antitumoral, com filmes de Langmuir de fosfolipídios, que servirão como modelos de membrana celular. Os fosfolipídios a serem empregados serão o dipalmitoilfosfatidil fosfatidilcolina (DPPC), e dipalmitoil fosfatidil serina (DPPS), que serão coespalhados com o bioativo. A interação do bioativo com as monocamadas de lipídios será avaliada através de medidas de isotermas de pressão e potencial de superfície, microscopia no ângulo de Brewster, espectroscopia no infravermelho, e reologia superficial. Os resultados serão avaliados sob a perspectiva de possíveis implicações biológicas, inferidas a partir dos efeitos causados pelo bioativo nas membranas artificiais.

Doenças neuromusculares formam um grande grupo de doenças que ocorrem por causa do mal funcionamento dos músculos e que podem se manifestar em razão da presença de mutações patogênicas em genes que codificam para proteínas musculares.Atualmente, o Sequenciamento de Nova-Geração figura como uma das melhores ferramentas para identificação de mutações patogênicas em pacientes de doenças neuromusculares. Através dele, centenas de genes podem ser analisados de uma vez, permitindo um diagnóstico mais rápido e eficiente.No laboratório, atualmente estudamos diversos grupos de doenças neuromusculares, como miopatias congênitas estruturais, distrofias musculares, como DMC2B, e miopatias associadas ao gene RYR1, incluindo a condição de Hipertermia Maligna. Os pacientes e famílias estudados participam de protocolos de pesquisa que visam entender os mecanismos genéticos, celulares e moleculares que estão envolvidos na manifestação clínica da doença. Como ênfase, os resultados do Sequenciamento de Nova-Geração são utilizados na busca de variantes genéticas que atuem como causa primaria da doença em estudo, ou como fatores de modulação da expressão fenotípica de algumas doenças, na tentativa de identificar possíveis alvos terapêuticos. Além disso, estamos estudando a associação de variantes ou haplótipos com possível efeito modificador do fenótipo dos pacientes. Assim sendo, neste plano de trabalho constam a análise dos resultados de Sequenciamento de Nova-Geração e RNA-Seq de pacientes de interesse científico que participam de protocolos de pesquisa do laboratório.Estudos em modelos animais para doenças neuromusculares também serão realizados para identificar fatores importantes no processo de degeneração e regeneração muscular durante o processo distrófico e do envelhecimento. As analises serão realizadas através de estudo de proteínas musculares in situ, e expressão de genes candidatos para essas vias.

O Estado de São Paulo é atendido por 7 concessionárias de distribuição no mercado cativo de fornecimento de energia elétrica, cada qual com seu modelo de fatura de consumo e demanda, resultando na necessidade de extração de dados customizada para cada uma delas. Além disso, o Governo do Estado de São Paulo detém 16,2 mil imóveis próprios, com 24 diferentes tipologias e perfis dentre as unidades de consumo (UCs), por exemplo escolas, delegacias e presídios, etc. Este projeto tem como intuito mapear os dados de consumo energético dos prédios da categoria de Iluminação Pública do Estado de São Paulo, mediante a criação de uma base de dados e a partir dela, criar um modelo matemático, com scripts de linguagem de programação (Python, R, &), para predição de consumo do próximo mês/ano. Com o desenvolver do modelo, dados como temperatura e regime de chuva da região, serão analisados e eventualmente incluídos na modelagem, melhorando sua exatidão. Caso sejam instalados novos equipamentos, buscaremos determinar quanto estes acarretarão no consumo. Além disso, pretende-se inserir dados gerados junto a "Plataforma BI para visualização dos dados de fatura de energia elétrica dos órgãos públicos", contribuindo com planos futuros de gestão, bem como proporcionar informações úteis quando da contratação de energia elétrica (mercado livre) e/ou indicativo para migração de grupo/modelo de fatura (mercado cativo) destas instituições.

Afídeos apresentam diversos simbiontes, tanto facultativos quanto obrigatórios, os quais podem promover diversas funções benéficas. Um exemplo de simbionte facultativo frequentemente presente em populações de diferentes espécies de afídeos é a bactéria Hamiltonella defensa, que protege seus hospedeiros do ataque de parasitoides, aumentando a sobrevivência dos afídeos contra os ataques a custo da redução de sua longevidade e fecundidade. A presença de simbionte em populações de afídeos é variável e depende de vários fatores, dentre eles a presença de inimigos naturais e das chances de propagação na população de seus hospedeiros. Assim, a vantagem em se abrigar simbiontes está relacionada a relação custo/benefício proporcionada. Por exemplo, na presença de parasitoides, abrigar H. defensa confere proteção e aumento de fitness aos afídeos, entretanto, na ausência desses inimigos naturais, devido à perda energética, a presença de simbiontes deixa de ser vantajosa aos indivíduos. A presença de simbiontes também depende das taxas de transmissão vertical, a qual é predominante e diz respeito à transmissão da microbiota de progenitor para prole, e de transmissão horizontal, na qual os microorganismos se propagam ao longo de toda uma população. A presença de simbiontes pode interferir nas interações dos afídeos com a comunidade a qual pertencem. Por exemplo, a riqueza e abundância de espécies vegetais que compõem a paisagem afeta diretamente a abundância das espécies de afídeos, a qual por sua vez, afeta indiretamente a abundância dos parasitoides associados a eles, aumentando a taxa de parasitismo e resultando na redução da população de afídeos. Esses efeitos "bottom-up" e "up-down" são responsáveis por manter o equilíbrio dessas populações, as quais se regulam por meio desse mecanismo de feedback negativo. Os simbiontes podem alterar através de alterações demográficas os efeitos destes feedbacks, atuando como fonte de diferenciação e adaptação populacional. Considerando os efeitos da paisagem (riqueza/abundância de plantas hospedeiras para os afídeos) e da presença de inimigos naturais sobre a variação e manutenção da população de simbiontes em populações de afídeos, este estudo tem como objetivo principal avaliar, através de modelagem matemática, as consequências das interações afídeos-parasitoides-simbiontes em paisagens com diferentes graus de heterogeneidade.

Os sistemas de distribuição de energia elétrica estão sendo reestruturados, modificados e adaptados para operar no ambiente de redes inteligentes (smart grids) com o intuito de permitir a integração de novos recursos energéticos distribuídos (REDs) como geração distribuída renovável, sistemas de armazenamento de energia, estações de carregamento de veículos elétricos etc. Essas tecnologias oferecem diversos benefícios operacionais e ambientais às redes de distribuição, mas também apresentam uma série de desafios que devem ser cuidadosamente abordados para evitar problemas operacionais do sistema, que podem variar dependendo da localização, tamanho e tipo de RED instalado. Além disso, a instalação desses recursos permite o surgimento de novos agentes no mercado de energia, que podem ter objetivos diferentes e/ou conflitantes com os objetivos da concessionária, dificultando o planejamento adequado dessas tecnologias. Como resultado, as concessionárias necessitam de ferramentas especializadas para auxiliá-las na tomada de decisões diante desses novos desafios. O presente projeto de pesquisa propõe abordar o problema de planejamento de sistema de distribuição e REDs que não são propriedade da concessionária usando a otimização multinível. Esse tipo de otimização permite modelar de forma hierárquica problemas que envolvem múltiplos agentes, encontrando uma solução equilibrada que otimiza os objetivos de cada participante. Desse modo, no nível superior, os objetivos da distribuidora serão tidos em conta; enquanto no nível inferior, os objetivos dos proprietários dos REDs serão considerados. Para representar o problema de planejamento, modelos matemáticos de otimização serão desenvolvidos. Esses modelos serão resolvidos usando solvers comerciais, bem como meta-heurísticas de busca em vizinhança variável. Além disso, a formulação do problema será estendida para considerar as incertezas associadas ao problema de planejamento. Os métodos propostos serão utilizados para resolver sistemas da literatura com diferentes graus de complexidade e os resultados serão comparados com os métodos existentes.

O uso de vibrações ultrassônicas para a osteotomia foi introduzido há três décadas como uma alternativa aos instrumentos mecânicos e elétricos que são usados em cirurgia oral convencional. A piezocirurgia pode beneficiar o clínico, permitindo osteotomias precisas realizadas em um campo claro e com pouco sangramento e principalmente sem o risco de danificar tecidos nobres, moles e nervosos. O objetivo deste trabalho é avaliar o reparo ósseo de defeitos críticos em calvária de ratos preenchidos com enxerto ósseo autógeno particulado obtido por meio de ultrassom cirúrgico. Serão utilizados 64 ratos (Rattus novergicus albinus, Wistar), machos, adultos divididos em quatro grupos: Grupo Coágulo sanguíneo (GC, 16), Grupo Autógeno Raspado com raspador ósseo (GAR, 16), Grupo Autógeno Raspado com Ultrassom cirúrgico (GAU, 16) e Grupo Autógeno Triturado (GAT,16). Será criado um defeito ósseo crítico na calvária de cada animal e preenchido com o osso autógeno de acordo com cada grupo, ou preenchido com coágulo sanguíneo no Grupo Coágulo. Os defeitos serão recobertos com membrana de cortical óssea bovina. Os animais serão eutanasiados aos 30 e 60 dias (8 em cada tempo). Serão realizadas análises histomorfométrica, imunoistoquímica e microtomográfica. Os dados obtidos serão submetidos a testes estatísticos para análise dos resultados.